日本语系（英语：Japonic languages，日语：日本语族），是美国学者列昂·安吉洛·塞拉菲姆（Leon Angelo Serafim）在2007年专著《日语与琉球语言的重音历史》中提出的一个语言学术语。根据塞拉菲姆的观点，日本语系包括日本语派和琉球语派两个分支，已确认的语言有十一种：
日语、冲绳语、宫古语、八重山语、喜界语、奄美语、德之岛语、国头语、冲永良部语、与论语和与那国语。有1亿2500万人以日本语系的语言为母语，是世界第八大语系。
不过，日本语系中的成员（即
日本语和琉球语）的分类仍然存在争议，有些学者将日本语系划归为“
阿尔泰语系”或
南岛语系下的语族，但这两个说法没有得到广泛支持，因为日本人缺少“阿尔泰父系”和南岛父系。
有学者根据同源词研究，日语有汉藏语系藏缅语族和南亚语系孟高棉语族的底层。日语和朝鲜语被认为不属於相同语系，仅仅是中古时期互相影响。